所有的身体器官的开口都是身体免疫预防的第一道防线。包皮的腺体能够分泌抗细菌和病毒蛋白，如溶菌酶，这种酶也存在于眼泪和母亲的乳汁中。特异的上皮细胞，如郎罕氏细胞，是免疫系统的组成成分，富含于包皮的外层表面。包皮黏膜的浆细胞能够分泌免疫球蛋白，是一种预防感染的抗体。
 

包皮覆盖阴茎头，对阴茎头起保护作用。在原始人类，此功能显得更为突出，原始人类由于要进行狩猎等活动，在深山老林里经常有各种蚊虫叮咬，由于阴茎头是比较敏感、易受刺激的部位，所以由于包皮覆盖，能使人群更为方便完成各种活动。现代人类，已不再进行狩猎等活动，并都有服装遮掩，增加了对生殖器的保护。包皮作为千万年来人类进化的结果，其保护作用不容忽视。