男性霉菌性尿道炎的潜伏期较难恰当，尤其是性同伴较多或无症状病原体携带者。男性霉菌性尿道炎典型的症状是尿道刺痒、轻重不一的尿频、尿急、尿痛和排尿艰苦。尿道口有粘液性或脓性分泌物，症状较淋病为轻。少量的分泌物，易见于较长时间不排尿或夜间没有排尿至晨起排尿前，有的发扬为痂膜封口或见内裤有淡黄色肮脏。自觉症状不明显或排尿时间间隔较短者，尿道分泌物易被尿液冲失。
 

男性霉菌性尿道炎检查见尿道口秋毫水肿或潮红、秋毫外翻，有粘液或脓性分泌物。沿阴茎根部至尿道口方向挤压尿道，可挤出粘液或脓性分泌物，偶有微薄触痛。患者自觉排尿时常、尿痛浓烈或排尿终末烧灼性疼痛。